Después de la invasión alemana de Polonia, Adamowicz se convirtió en miembro del Ejército Nacional clandestino (Armia Krajowa) como mensajera clandestina. Entregó mensajes y brindó ayuda y apoyo moral a los guetos judíos en varias ciudades distantes. En 1985 Adamowicz recibió póstumamente el título de Justo entre las Naciones de Yad Vashem en Jerusalén por sus actos heróicos contra el Holocausto nazi.
Debido a su trabajo para la juventud polaca y judía antes de la invasión de Polonia, y su estrecho contacto con el movimiento sionista judío, Adamowicz, una cristiana devota, pudo acudir en ayuda de los esfuerzos de la Organización de Lucha Judía para establecer un canal de comunicación. entre los guetos de diferentes ciudades. En una reunión en Varsovia a fines de 1941, los representantes de AK, incluidos Irena Adamowicz y Stanislaw Hajduk, y, en el lado judío, Mordechaj Anielewicz, Icchak Cukierman, Josef Kaplan y Cywia Lubetkin, tomaron la decisión de embarcarse en este peligroso esfuerzo. A lo largo del verano de 1942, Adamowicz realizó un atrevido viaje por Polonia y Lituania para establecer contacto entre organizaciones clandestinas en los guetos de Varsovia, Wilno (ahora Vilnius), Białystok, Kovno (ahora Kaunas) y Shavle (Šiauliai). Sus visitas se convirtieron en una fuente tanto de información vital como de aliento moral, como su presencia inspiradora en el gueto de Kovno en julio de 1942. Se ganó el apodo judío de "Di chalutzishe shikse", la gentil pionera.
Tras el final de la Segunda Guerra Mundial, Adamowicz permaneció en estrecho contacto con los sobrevivientes del Holocausto, con quienes había trabajado en la clandestinidad judía. Gracias a sus esfuerzos, fue nombrada Justa entre las Naciones en 1985. Su experiencia personal se convirtió en parte del libro de Bartoszewski y Lewin titulado Righteous Among Nations; How Poles Helped the Jews, 1939–1945.
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